明末医家吴有性认为：温疫邪气侵犯人体的途径不同，当是从口鼻而入，其侵犯部位既不在表，也不在里，而是由口鼻侵入，停留在半表半里之间，此处称为膜原。这里的膜原，是说明温疫之邪在人体之内，外可连于表，内可入于里的特点。指出温疫之病所以用治外感病的方法治疗不得痊愈，就是因为此病邪的部位不同于一般外感病的在表或在里，而是在于半表半里的膜原，这个部位是一般药物所不能到达的。由于其既连表又连里，邪气盛时则可出表或入里，这时才可根据邪气溃散的趋势，因势利导予以治疗。其《温疫论》中写道：

凡人口鼻之气，通乎天气，本气充满，邪不易入，本气适逢亏欠，呼吸之间，外邪因而乘之。昔有三人，冒雾早行，空腹者死，饮酒者病，饱食者不病。疫邪所着，又何异耶？若其年气来盛厉，不论强弱，正气稍衰者，触之即病，则又不拘于此矣。其感之深者，中而即发；感之浅者，邪不胜正，未能顿发，或遇饥饱劳碌，忧思气怒，正气被伤，邪气始得张溢，营卫营运之机，乃为之阻，吾身之阳气，因而屈曲，故为病热。

清代名医刘奎继承了吴有性的观点，而其著作中，在用香防未病、治已病方面，又增加了不少内容。

刘奎又名刘复明，字文甫，号松峰，山东潍坊诸城人。自幼习儒，为清朝监生。与清代阁士刘墉为叔兄弟。因自身患病，发愤学医，曾跟叔父刘统勋去北京，学医于郭右陶。他对《内经》、《难经》精研深究，对金元四家及张景岳等人的名著，勇于探索，融古出新，在治疗瘟疫症方面独树一帜。《松峰说疫》为刘奎的代表作之一。

《松峰说疫》第二卷“除秽”一节写道：

凡瘟疫之流行，皆有秽恶之气，以鼓铸其间。试观入瘟疫之乡，是处动有青蝇，千百为群。夫青蝇乃喜秽之物，且其鼻最灵，人所不闻，而蝇先闻之，故人粪一抛，而青蝇顿集，以是知青蝇所聚之处，皆疫邪秽气之所钟也。更兼人之秽气，又有与之相济而行者。凡凶年饥岁，僵尸遍野，臭气腾空，人受其熏触，已莫能堪，又兼之扶持病疾，敛埋道 ，则其气之秽，又洋洋而莫可御矣。夫人而日与此二气相习，又焉得不病者乎！使不思所以除之，纵服药亦不灵，即灵矣，幸愈此一二人，而秽气之弥沦布 者，且方兴而未有艾也，可不大畏乎！兹定数方，开列于下，倘瘟疫之乡，果能焚烧佩带，则不觉，秽气之潜消，而沉疴之顿起矣。

除秽靖瘟丹（自定新方。将药末装入绛囊，约二三钱，毋太少，阖家分带，时时闻臭，已病易愈，未病不染。）

苍术 降真香 川芎 大黄（各二钱） 虎头骨 细辛 斧头木（系斧柄入斧头之木） 鬼箭羽 桃枭（小桃干在树者） 白檀香 羊踯躅 羌活 甘草 草乌 本 白芷 荆芥 干葛皮 山甲 羚羊角 红枣 干姜 桂枝 附子 锻灶灰 川椒 山奈 甘松 排草 桂皮（各一钱，共为粗末）

明雄（二钱） 朱砂（二钱） 乳香（一钱） 没药（一钱，四味另研，共和）

苍降反魂香（自定。）

苍术 降真香（各等分）

共末，揉入艾叶内，绵纸卷筒，烧之，除秽祛疫。